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小球藻属DNA条形码的鉴定研究
时间: 2021年3月10日 点击率: 1675
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小球藻属DNA条形码的鉴定研究

张稚兰1,邢炳鹏1,2

(1.自然资源部第三海洋研究所 厦门 361005;

2.自然资源部北部湾滨海湿地生态系统野外科学观测研究站 北海 536015)

    摘要:为探讨小球藻鉴定的新方法以及评估小球藻属 DNA 条形码候选序列的鉴定作用,文章对20株小球藻的线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)、核基因组rDNA的内转录间隔区(ITS)以及核酮糖1,5-二磷酸羧化酶(rbcL)3个片段进行PCR扩增测序,并对各序列进行生物信息学分析。研究结果表明:COI、ITS和rbcL序列在20株小球藻中的扩增和测序效率均呈阳性,扩增成功率分别为76%、83%和70%;经评估,COI、ITS和rbcL序列作为DNA条形码在小球藻分类鉴定中均不适合较低的分类单位,但可参考动植物的分类方法,将多个片段组合应用,从而筛选不同进化级别的DNA条形码。

    关键词:小球藻;DNA条形码;分类鉴定;物种;基因

    基金项目:自然资源部第三海洋研究所基本科研业务费专项资金资助项目(海三科2015012、海三科2019015).

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